Debido a la gran calidad de los programas posgrado y la indiscutible aceptación de los profesionales del Ecuador, a partir del 12 de junio de 2006, la Dirección de Posgrados adoptó el estatus académico de Unidad de Gestión de Posgrados. Con ello se incrementó el número de programas de cuarto nivel, siendo estos posgrados tanto profesionalizantes como de investigación que se dictaban en las modalidades presencial y semipresencial.
26 de noviembre de 2019.
El 26 de noviembre de 2019, mediante orden de Rectorado ESPE-HCU-OR-2019-2014 y la resolución ESPE-HCU-RES.2019-2014 se transforma en Centro de Posgrados, con el fin de ampliar las opciones de postgrado en todas las modalidades.